OS 用アプリとしての littler

apt show littler によれば， “GNU R scripting and command-line front-end” とのことで，ターミナル上での R スクリプト実行を容易にしてくれるもののようです．

yutannihilation 氏による紹介記事もあります (littlerを使ってRで危険シェル芸とかできそう)．

以下のように，Rコマンドを文字列として渡すことでシェル上で実行できるようになります．

r -e 'print("Hello World!")'

また，行頭には #!/usr/bin/env r と Shebang を記た hello.r を用意し，

#!/usr/bin/env r
print("Hello World!")

実行可能にするとちゃんと走ります．

chmod +x hello.r
./hello.r
# [1] Hello World!

R パッケージとしての littler

• CRAN: https://cran.r-project.org/package=littler
• GitHub: https://github.com/eddelbuettel/littler

OS 用 littler の実行ファイルと，サンプルスクリプトの詰め合わせ……かな？

実行ファイルは， system.file("bin", "r", package="littler") にあるので，これを PATH の通った場所にシンボリックリンクしてやれば，手動で OS 用アプリとしての littler をインストールできるようです．

サンプルスクリプトは inst/examples にいっぱいありますが，今回は rocker で利用できるもののみ紹介します．

install.r

シンプルな CRAN 上の R パッケージインストール用スクリプト．引数にはインストールしたいパッケージしか指定できない．インストール時の細かい挙動を弄りたい人は install2.r へ．

簡単な用例:

install.r dplyr tidyr

install2.r

CRAN 上の R パッケージをインストールするための，ちょっとリッチなスクリプト．以下の様々な引数を利用できる．

-l --libloc LIBLOC  パッケージインストール先 
                    [default: /usr/local/lib/R/site-library]
-d --deps DEPS      依存しているパッケージをインストールするか 
                    [default: NA]
-n --ncpus NCPUS    インストールを並列化する時のスレッド数 
                    [default: getOption]
-r --repos REPOS    参照するレポジトリ．複数可．ファイルからなら NULL を指定．
                    [default: getOption]
-e --error          警告をエラー扱いにしてスクリプトを停止させるか 
                    [default: FALSE]
-s --skipinstalled  インストール済みのパッケージのインストールはスキップするか 
                    [default: FALSE]
-h --help           install2.r のヘルプを見る
-x --usage          ヘルプと簡単な用例を見る

簡単な用例は

install2.r dplyr tidyr --error --deps TRUE

で R でいうところの

install.packages(c("dplyr", "tidyr"), error = TRUE, dependencies = TRUE)

に相当．

installGithub.r

GitHub 上の R パッケージをインストールするためのスクリプト．中身は remotes::install_github のラッパー．以下の様々な引数を利用できる．

-d --deps DEPS       依存パッケージをインストールするか 
                     [default: NA]
-u --update UPDATE   依存パッケージをアップデートするか 
                     [default: TRUE]
-r --repos REPOS     依存パッケージをインストールする時に使うレポジトリ 
                     [default: getOption]
-h --help            ヘルプを表示
-x --usage           ヘルプと用例を表示

簡単な用例:

installGithub.r RcppCore/[email protected]

testInstalled.r

インストール済みのパッケージをテストするためのスクリプトで， tools::testInstalledPackage のラッパーらしい．

-l --libloc LIBLOC  パッケージのインストール先 
                    [default: NULL]
-o --outdir OUTDIR  結果の保存先 
                    [default: .]
-t --types TYPES    テスト内容 
                    [default: c('examples', 'tests', 'vignettes')]
-s --srcdir SRCDIR  追加したい .save ファイルの参照先 
                    [default: NULL]
-h --help           ヘルプを表示